در درمان دارویی از متوتروکسات که یک داروی ضد سرطان است بصورت وریدی یا خوراکی استفاده شده که حین استفاده، باید از استعمال nsaid ها، ورزش کردن، مصرف الکل و اسیدفولیک و هرگونه مکمل دارای اسیدفولیک پرهیز شود.
همچنین باید دقت داشت تا فرد حداقل قرارگیری در معرض نور را داشته باشد. در حین استفاده از این روش تیتر آزمایش بتا هم به کار گرفته می‌شود؛ در استفاده از متوتروکسات عملکرد کبدی شما اهمیت دارد، اگر بیمار مبتلا به بیماری های مزمن کبدی باشد احتمال تغییر پلن درمانی وجود دارد.
درمان جراحی شامل لاپاراتومی و لاپاراسکوپی است که با توجه آسیب به لوله و خون ریزی اقدام به هرکدام می‌شود؛ اگر جنین کوچک باشد و به لوله نیز صدمه ایی وارد نشده باشد و تیتر آزمایش بتا پایین نیاید، از لاپاراسکوپی استفاده می‌شود. لاپاراتومی در صورتی است که فرد دچار خون ریزی داخلی شده و احتملا لوله دچار آسیب گشته است.
در این کیس ها حفظ لوله به وضعیت بیمار بستگی خواهد داشت و گاهی بیمار لوله خود را از دست خواهد داد. از عوامل موثر بر ایجاد حاملگی خارج رحمی می‌توان کلیه جراحی‌های روی لوله‌های رحمی و لگن، عفونت های لگنی و لوله‌ایی و توبکتومی ناموفق (بستن لوله) را نام برد. همچنین باید دانست که شاید مهم ترین عامل ایجاد حاملگی خارج رحم، سابقه حاملگی خارج رحمی می‌باشد.
